一級水系に属する水力発電所を水系別に紹介しています。
（カバーし切れていない部分も有りますがご了承ください）
また、一級河川に接続する普通河川も併せて掲載しています。
本データの内、河川に関するデータは一般社団法人 国際建設技術協会様、公益社団法人 日本河川協会様の御厚意により許可を頂いて掲載しています。
水系名の前に表示されている数字は一級水系番号を示します。
水系番号が［ ］、（ ）で括られている水系は詳細が有ります（水力発電所が無い水系も在ります）。
水系番号が［ ］で括られている水系は当サイトの水力発電所ギャラリーに１箇所以上掲載されています。
また、｛ ｝内は国土交通省河川局様の整備局名を示します。
なお、表の空欄の部分は、表での河川の位置を実際の位置関係と大きくずらさないための余白です。
| 大平洋側日高山脈より西、日本海側 | 大平洋側日高山脈より東、オホーツク海側 |
| ｛北海道｝ | |
| ［１］ 天塩川（てしおがわ）水系 | ［２］ 渚滑川（しょこつがわ）水系 |
| （６） 留萌川（るもいがわ）水系 | ［３］ 湧別川（ゆうべつがわ）水系 |
| ［７］ 石狩川（いしかりがわ）水系 | （４） 常呂川（ところがわ）水系 |
| ［８］ 尻別川（しりべつがわ）水系 | ［５］ 網走川（あばしりがわ）水系 |
| ［９］ 後志利別川（しりべしとしべつがわ）水系 | |
| ［１０］ 鵡川（むかわ）水系 | （１２） 釧路川（くしろがわ）水系 |
| ［１１］ 沙流川（さるがわ）水系 | ［１３］ 十勝川（とかちがわ）水系 |
［４６］富士川と［４５］狩野川の位置が逆に表記されていますが、整備局の区分表記の都合上です。
| 瀬戸内海側 | 大平洋側 |
| ｛四国｝ | |
| （８４） 土器川（どきがわ）水系 | ［８２］ 吉野川（よしのがわ）水系 |
| ［８３］ 那賀川（なかがわ）水系 | |
| ［８５］ 重信川（しげのぶがわ）水系 | ［８７］ 物部川（ものべがわ）水系 |
| ［８６］ 肱川（ひじかわ）水系 | ［８８］ 仁淀川（によどがわ）水系 |
| ［８９］ 渡川（わたりがわ）［四万十川（しまんとがわ）］水系 | |
| 東シナ海側 | 瀬戸内海、大平洋側 |
| ｛九州｝ | |
| （９０） 遠賀川（おんががわ）水系 | （９１） 山国川（やまくにがわ）水系 |
| （９４） 松浦川（まつうらがわ）水系 | |
| （９５） 六角川（ろっかくがわ）水系 | （１０２） 大分川（おおいたがわ）水系 |
| （９６） 嘉瀬川（かせがわ）水系 | （１０３） 大野川（おおのがわ）水系 |
| （９２） 筑後川（ちくごがわ）水系 | |
| （９３） 矢部川（やべがわ）水系 | （１０４） 番匠川（ばんじょうがわ）水系 |
| （９７） 本明川（ほんみょうがわ）水系 | |
| （９８） 菊池川（きくちがわ）水系 | （１０５） 五ヶ瀬川（ごかせがわ）水系 |
| （９９） 白川（しらかわ）水系 | |
| （１００） 緑川（みどりかわ）水系 | （１０６） 小丸川（おまるがわ）水系 |
| （１０１） 球磨川（くまがわ）水系 | （１０７） 大淀川（おおよどがわ）水系 |
| （１０８） 川内川（せんだいがわ）水系 | （１０９） 肝属川（きもつきがわ）水系 |